所以這個時候，中郎將的職權(quán)發(fā)生了變化，他們已經(jīng)不是監(jiān)軍，成為了親自統(tǒng)兵作戰(zhàn)的將領(lǐng)。
　　
　　但中郎將終究是朝廷的直屬官員，他們沒有地方上的官職，作戰(zhàn)完畢后，終究是要回到中央去的。
　　
　　這時候，三將已經(jīng)名震天下，董卓、袁紹、曹操這些人還排不上號，他們就是手握軍權(quán)的真正的大佬。
　　
　　這時皇甫嵩的威信達(dá)到頂峰，漢陽人閻忠甚至勸他把握機會，自立稱帝。
　　
　　皇甫嵩當(dāng)然不會考慮，他和朱儁二話沒說，交出了軍權(quán)回到京城，繼續(xù)當(dāng)他們的京官。
　　
　　這時候，董卓在哪里呢？
　　
　　董卓剛被赦免。
　　
　　因為攻打下曲陽不利，董卓也步盧植后塵被罷免，押送回京師受審，判的罪名是“減死罪一等”，也就是個被流放的命。
　　
　　恰好，皇甫嵩在前線大獲全勝，皇帝一高興大赦天下，董卓這才被赦免。
　　
　　顯然，這時候皇甫嵩和董卓的地位是一個天一個地，董卓一口吃不成以后的大胖子，他還得繼續(xù)發(fā)育。
　　
　　一年后，中平二年（185年），涼州又發(fā)生叛亂，朝廷又派已被拜為左車騎將軍的皇甫嵩領(lǐng)軍出征，董卓拜為中郎將當(dāng)他的副手。
　　
　　在這一年的戰(zhàn)斗力，皇甫嵩有點背，作戰(zhàn)不利被罷免，董卓卻出了點風(fēng)頭，六路人馬里只有他一路全軍班師沒遭到什么損失，從而被封為斄鄉(xiāng)侯。
　　
　　中平五年（188年），涼州再次告急，朝廷還是啟用皇甫嵩、董卓為正副手。
　　
　　這次作戰(zhàn)，皇甫嵩指揮有方，大勝叛軍，董卓對皇甫嵩又忌妒又恨。
　　
　　撲滅黃巾后，皇甫嵩以名將之威望，仍然是朝廷出兵平叛的第一選擇，董卓這時雖偶有表現(xiàn)，還遠(yuǎn)遠(yuǎn)夠不上對皇甫嵩形成威脅。
　　
　　?
　　
　　錯失良機
　　
　　第二年，漢靈帝病重，下詔拜董卓為并州牧，同時命令董卓把兵權(quán)轉(zhuǎn)交給皇甫嵩。董卓暗藏野心，不肯交出軍隊，上書狡辯。
　　
　　這時皇甫嵩的從子皇甫酈看出董卓暗藏禍心，于是勸說父親趁機除掉董卓，皇甫嵩認(rèn)為，董卓雖然有罪，自己沒有旨意誅殺他恐怕也要負(fù)責(zé)。所以他還是上奏朝廷，朝廷只是責(zé)備了董卓，卻沒有采取其他措施。
　　
　　這是皇甫嵩第一次錯過滅掉董卓的機會。
　　
　　就在同一年，保留有兵力的董卓本來該到并州去上任，他走到河?xùn)|郡就不動彈了，因為他想留在這里觀望局勢，看看是否有機可乘。
　　
　　機會果然來了，帶著兵的董卓離洛陽較近，被大將軍何進看中，私自招董卓帶兵入京。
　　
　　隨后發(fā)生的事就比較著名了，何進被十常侍殺死，董卓趁亂進京，立下救駕之功，吞并了何進、何苗、丁原等人的軍隊，一家獨大，掌控了朝政。
　　
　　即使這樣，皇甫嵩也還有機會對付董卓，他當(dāng)時并不在京城，而是統(tǒng)兵三萬駐扎在扶風(fēng)郡?；矢︶悦鹛煜?，對董卓是個巨大的威脅，如果他能果斷決策，振臂一呼，局勢未穩(wěn)的董卓未必能吃得消，因為在外有袁紹等反對勢力，即使在他控制的京城，也存在著王允等堅決反對董卓的力量，而皇甫嵩在各地諸侯間也有很大威信。
　　
　　?
　　
　　但是，皇甫嵩又服軟了，他聽從了董卓的征召，給他的官職是城門校尉，不知皇甫嵩是怎么想的，城門校尉雖然也是京城有實權(quán)的軍職，又怎么比得上現(xiàn)在的手握重兵，身處董卓控制之外來得有用。