凌晨，5:00，全息會議室。
　　碇司令坐在一片黑暗之中，冬月副司令站在他的身旁，在他們二人的周圍，黑暗的虛空中漂浮著十二塊黑色的墓碑，每個墓碑上面都有一個鮮血一般赤紅的編號，從01一直到12，再加上碇司令這個“13”，正好象征著耶穌的十三位門徒。
　　01基路議長：“約定的日子到了，碇源堂?！?br/>　　碇司令：“人類應該邁向更加光明的未來，eva就是為此而存在的。”
　　碇司令使徒說服seele，但是seele不為所動。
　　12：“這是為了讓閉塞的人類獲得新生的必要儀式?！?br/>　　07：“毀滅的宿命中也包含著新生的喜悅?！?br/>　　03：“為了讓神、人與其他所有生物通過死亡融為一體?！?br/>　　01基路議長：“死亡，將孕育新生。”
　　碇源堂：“死亡，什么也孕育不了?！?br/>　　01基路議長：“死亡，就給予你們吧！”
　　話音落下，十二塊墓碑全部消失了，黑暗的虛無中只剩下了碇源堂和冬月。
　　冬月面色沉重：“談判破裂了啊?！?br/>　　碇源堂面無表情：“預料之中?！?br/>　　……………………
　　6:00
　　當手機鬧鈴響起來的一瞬間，李曉猛然睜開了雙眼。
　　此時，李曉正躺在nerv四層的某間臥室中，自從碇司令發(fā)布了“禁止所有人員進出本部”的命令后，李曉和美里他們就睡在了本部中。
　　鬧鈴是由佩琪控制的，李曉醒了后，鬧鈴就自動停止了。
　　李曉在床上慢慢坐起身子，神情嚴肅的盯著前方不知名的某處看了一會兒，似乎是在想什么事情，一點都不像是剛剛睡醒的樣子。事實上，昨天晚上李曉并沒有睡好，幾乎是一夜未睡，因為李曉的“happyend補完計劃”終于走到了最后，最后的終焉之戰(zhàn)即將來臨。
　　李曉扭頭看了一眼床頭柜上的手機，張口問：“佩琪，已經開始了？”
　　佩琪的聲音隨即響起：“開始了?！?br/>　　佩琪說完，整個nerv突然響起了刺耳的警報聲……
　　“嗡——嗡——嗡——”
　　整個作戰(zhàn)大廳在警報聲中忙作一團，日向誠、青葉茂、伊吹瑪雅，三個人在各自的崗位上神色緊張的忙碌著，美里幾乎是以百米沖刺的速度跑進作戰(zhàn)大廳，進來后第一句話就問：“發(fā)生了什么？！”
　　日向誠回過頭大聲回答：“有不明終端入侵本部網絡！”
　　青葉茂：“所有外界終端都有數(shù)據入侵，連接外界的所有線路正在被不斷切斷！”
　　美里的臉色瞬間陰沉下來：“網絡戰(zhàn)……想讓我們變成瞎子和聾子嗎？對方是沖著magi來的。”
　　伊吹瑪雅：“檢測到攻擊數(shù)據來源！”
　　美里扭頭看過去：“是松代的magi二號機嗎？”
　　伊吹瑪雅：“不止，檢測到至少五種magi型機組！”
　　“五種？！”美里大吃一驚?！皊eele這次真是下了血本了?！?br/>　　伊吹瑪雅：“現(xiàn)在，赤木前輩正在magi內部署防御系統(tǒng)！”
　　“律子……”美里快步走到第二層邊緣，向下面看了看第三層那三臺超級計算機，此時，律子就在那里面。
　　這時，日向誠忽然像是發(fā)現(xiàn)了什么了，臉上露出不敢置信的驚愕表情，他愣了一小下，然后急忙向美里匯報：“入侵終端傳來一份來自第二新東京市的a-801通牒！”
　　美里疑惑的一皺眉，立馬湊過去看向日向誠的屏幕：“a-801？”
　　“廢除特務機關nerv的一切法律保障，現(xiàn)裁定nerv為非法組織，并將其移交給rb政府指揮?！比障蛘\快速的解釋說。
　　美里飛快的讀完這份通牒，用力的咬了咬牙：“看來這是最后通牒了?！?br/>　　聽完日向誠的解釋，伊吹瑪雅不禁露出驚恐疑惑的表情，這個可憐的女孩兒還被蒙在鼓里：“為什么政府要這樣做？為什么要突然取締nerv的合法身份？”
　　美里看了伊吹瑪雅一眼，沒有解釋，但事實上她心中卻十分清楚，這一切都是seele所為，seele的目的就是占領本部，搶奪eva、亞當和莉莉絲，因為如果想要完成人類補完，發(fā)動第三次沖擊，亞當和莉莉絲是必不可少的。對magi的入侵還僅僅只是開始，真正的動作還在后面。