四月，劉協(xié)在荀彧、張楊等人護(hù)送下，回至洛陽，逃往野王的董承也得以率兵還回。小皇帝的東歸之路整整走了十個(gè)月。獻(xiàn)帝以護(hù)駕之功，遷張楊大司馬，董承為大將軍，郭太為車騎將軍、劉琦為驃騎將軍、假司隸校尉，皆假節(jié)。
　　洛陽經(jīng)歷董卓之亂后，已成廢墟，劉協(xié)居于新修之南宮楊安殿，百官皆無住所，“披荊棘，依墻壁間”。時(shí)州郡貢奉不至，洛陽糧荒，郡臣饑乏，或有餓死者。君臣處境十分狼狽。
　　建安元年（196）二月，曹操在兗州站穩(wěn)腳跟后，開始向外擴(kuò)展勢力。時(shí)汝南郡、潁川郡，黃巾軍何義、劉辟、黃邵、何曼等部，各有兵數(shù)萬，趁曹呂相爭起兵攻掠城池。曹操率兵進(jìn)擊，在許縣一帶擊破何義等軍，勢力發(fā)展到豫州，軍隊(duì)實(shí)力也有`所增強(qiáng)，漢廷拜曹操為建德將軍。
　　攻下許縣以后，曹操與眾謀士商定迎接皇帝。于是派遣大將曹洪至洛陽迎接獻(xiàn)帝，董承等拒險(xiǎn)阻擋，曹洪未能如愿。
　　劉協(xié)回到洛陽后，荀彧暫留宮中聽用，被命為待中。大臣張楊、董承等互相猜忌不和。議郎董昭認(rèn)為曹操是天下英雄，與曹操聯(lián)系。董昭拉攏董承說張揚(yáng)是袁紹黨羽，而袁紹又不愿奉天子；而劉琦地處邊塞，好征伐。正好這時(shí)董承把持朝庭兵馬又無糧草，而朝中又沒有黨援，便假作曹操收信于董承，信中說曹操愿為董承外援，并說董承有兵，曹操有糧，正好互通有無。董承得信大喜，遂表曹操為鎮(zhèn)東將軍，襲父爵費(fèi)亭侯。不久，董承因郭太、張楊等據(jù)功自傲胡作非為，暗中召曹操入朝，以制張楊等人。
　　五月，曹操帶兵入洛陽朝見劉協(xié)，一碗雞湯收買了劉協(xié)柔弱的心靈，然后奏郭太、張楊之罪。郭太再逃河?xùn)|，獻(xiàn)帝因郭太等護(hù)送之功，詔令赦免。獻(xiàn)帝遂以曹操領(lǐng)司隸校尉、錄尚書事、假節(jié)鉞。曹操以護(hù)駕之功奏封衛(wèi)將軍董承等十三人為列侯，以罪殺侍中臺崇、尚書馮碩等三人，初執(zhí)朝政。荀彧看穿曹操狼子野心，多次勸諫劉協(xié)，劉協(xié)不從。荀彧心恢心冷，急發(fā)書信與劉琦。
　　建安元年（196）六月，曹操入朝執(zhí)政后，本想遷都于許縣，但因獻(xiàn)帝久經(jīng)顛沛流離，形勢初定，怕再次遷都遭人非議，為此猶豫不決。于是問計(jì)于議郎董昭。董昭說，現(xiàn)洛陽諸將人多意雜，不一定服從，要成就大事，只有遷都。董昭又對曹操說，行非常之事，才能有非常之功，希望曹操深思熟慮，從大處著眼，早日決斷。董昭建議曹操先遣使拜謝董承表自己為鎮(zhèn)東將軍的恩情，以安董承之心，然后對董承表示，洛陽糧食困難，先讓獻(xiàn)帝暫時(shí)到距離許縣較近的魯陽，以便保證糧食供應(yīng)。董承居功自傲一定不會懷疑，然后將獻(xiàn)帝直接迎至許縣。
　　六月中旬，劉琦平定弘農(nóng)全境，屯兵澠池，率三千神刀衛(wèi)進(jìn)入洛陽。
　　曹操、劉琦二人本就有舊，見面相互客套一番。
　　朝堂上，曹操已買通百官，勸說劉協(xié)遷都。荀彧已是百口莫辯，見劉琦低頭不語，也住口不言。劉協(xié)見迎他東歸的最大功臣不高興了，就更加為難了，問劉琦道：“皇兄，這洛陽確實(shí)破敗，實(shí)在不適作為國都。兄有何議？何不說出來大家商議？”
　　“陛下即欲遷都，何不遷往晉陽？穎川多賊亂，而并州安定多年，驃騎將軍勤政愛民，晉陽城的繁華已不下當(dāng)日的東都。”荀彧再次反駁。